新疆部分地区人类免疫缺陷病毒/丙型肝炎病毒合并感染者的丙型肝炎病毒5′端非编码区基因变异分析

中华传染病杂志, 2016, 34(3)

Chin J Infect Dis, 2016, Vol.34, No.3

摘要：

目的 了解新疆部分地区HIV-1/HCV合并感染者的HCV基因变化规律。

方法 采用ELISA法检测212例HIV-1感 染 者 的 抗-HCV，柱 式 核 酸 纯 化 试 剂 盒 提 取 血 浆 中 病 毒RNA，以PrimeScript^TM Ⅱ 1st Strand cDNA Synthesis试剂盒进行反转录，并扩增HCV 5′端非编码区(5′UTR)基因，将所获序列与HCV国际标准株进行比较,确定HCV基因型。计算4次采样毒株序列变异的基因离散率并建立进化树。

结果 212例HIV-1感染者中抗-HCV阳性157例，155例为静脉药瘾者，2例为异性性接触者。131例成功扩增HCV 5′UTR基因并进行了基因分型,结果3a基因型占30.53%(40/131)、3b基因型占17.56%(23/131)、1a基因型占8.40%(11/131)、1b基因型占42.75%(56/131)、6a基因型占0.76%(1/131)。完成2年随访的38例感染者整体基因同源性为87.5%~99.3%，不同亚型的同源性有差异，同一样本的4次序列的同源性为99.3%~100.0%，变异率为0~0.7%。随着采样时间的推移，组内基因离散率以及与首次采样序列的组间基因离散率呈现依次增大的趋势。新疆地区HIV-1感染者体内的HCV的5′UTR基因平均进化速率为1.62×10^-3替换/(位点·年)(95%CI:1.52×10^-3~5.38×10^-3)。同一研究对象的4次序列之间相似度和同源度最高。

结论 新疆地区HIV/HCV合并感染率较高，静脉药瘾者高于异性性接触者。HCV以1b亚型为优势流行毒株。

关键词：人类免疫缺陷病毒-1，肝炎病毒属，5′端非编码区，基因离散率，进化速率

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