蛋白质结构限制性对HIV-1耐药相关基因分子进化规律的影响研究
中华微生物学和免疫学杂志, 2016, 36(6)
Chin J Microbiol Immunol, 2016, Vol.36, No.6
摘要:
目的 通过对65名HIV治疗队列中发生耐药的感染者进行较系统的前瞻性队列研究,阐明我国抗病毒治疗过程中,HIV RT蛋白耐药进化的结构限制性以及HIV耐药的发生规律。
方法 从2003年开始,每半年1次,连续4年对队列感染者进行随访采集静脉血样,提取病毒RNA后对RT基因进行RT-PCR扩增和测序。将所获得的序列进行系统进化、耐药位点变异和蛋白质结构分析。
结果 RT酶中大部分的氨基酸位点都是保守的,而序列的变异仅发生在12.44%的位点之上。非核苷类逆转录酶抑制剂(NNRTI)高水平耐药位点多位于RT蛋白的内部,而中等水平耐药位点多位于蛋白质的表面。核苷类逆转录酶抑制剂(NRTI)高水平耐药位点均位于RT蛋白的表面,而低水平耐药位点均位于RT蛋白的内部。
结论 NNRTI和NRTI类耐药突变位点在RT蛋白中截然相反的分布特征,可以为针对RT靶点的抗病毒药物的设计和开发起到一定的指导作用。
关键词:人类免疫缺陷病毒1型,选择压力,适宜性,结构限制
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